MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 60669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014654	AGA	2	6	126	131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142409
2	NC_014654	A	6	6	138	143	100 %	0 %	0 %	0 %	312142409
3	NC_014654	TAA	2	6	229	234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142409
4	NC_014654	AT	3	6	262	267	50 %	50 %	0 %	0 %	312142409
5	NC_014654	TAATT	2	10	268	277	40 %	60 %	0 %	0 %	312142409
6	NC_014654	AATG	2	8	305	312	50 %	25 %	25 %	0 %	312142409
7	NC_014654	A	7	7	343	349	100 %	0 %	0 %	0 %	312142409
8	NC_014654	A	6	6	374	379	100 %	0 %	0 %	0 %	312142409
9	NC_014654	A	6	6	388	393	100 %	0 %	0 %	0 %	312142409
10	NC_014654	TAA	2	6	394	399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142409
11	NC_014654	CTGAT	2	10	402	411	20 %	40 %	20 %	20 %	312142409
12	NC_014654	TGA	2	6	421	426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142409
13	NC_014654	GAT	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142409
14	NC_014654	AGG	2	6	447	452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142409
15	NC_014654	GAA	2	6	455	460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142409
16	NC_014654	TAA	2	6	466	471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142409
17	NC_014654	GTA	2	6	506	511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142409
18	NC_014654	TGC	2	6	535	540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142409
19	NC_014654	TTTA	2	8	587	594	25 %	75 %	0 %	0 %	312142409
20	NC_014654	A	6	6	652	657	100 %	0 %	0 %	0 %	312142409
21	NC_014654	GAT	2	6	728	733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142409
22	NC_014654	TGA	2	6	784	789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142409
23	NC_014654	GAA	2	6	824	829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142409
24	NC_014654	T	6	6	830	835	0 %	100 %	0 %	0 %	312142409
25	NC_014654	ACAG	2	8	864	871	50 %	0 %	25 %	25 %	312142409
26	NC_014654	TAA	2	6	873	878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142409
27	NC_014654	CCA	2	6	893	898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142409
28	NC_014654	TAA	2	6	951	956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142409
29	NC_014654	A	6	6	1003	1008	100 %	0 %	0 %	0 %	312142409
30	NC_014654	TTAT	2	8	1047	1054	25 %	75 %	0 %	0 %	312142409
31	NC_014654	TTC	2	6	1120	1125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142409
32	NC_014654	TTG	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142409
33	NC_014654	TAA	2	6	1183	1188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142409
34	NC_014654	A	6	6	1190	1195	100 %	0 %	0 %	0 %	312142409
35	NC_014654	A	7	7	1229	1235	100 %	0 %	0 %	0 %	312142409
36	NC_014654	TTA	2	6	1236	1241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142409
37	NC_014654	A	7	7	1280	1286	100 %	0 %	0 %	0 %	312142409
38	NC_014654	TGG	2	6	1378	1383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142409
39	NC_014654	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142409
40	NC_014654	A	6	6	1428	1433	100 %	0 %	0 %	0 %	312142409
41	NC_014654	A	6	6	1435	1440	100 %	0 %	0 %	0 %	312142409
42	NC_014654	GAA	2	6	1442	1447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142409
43	NC_014654	CAATA	2	10	1477	1486	60 %	20 %	0 %	20 %	312142409
44	NC_014654	AGA	2	6	1811	1816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142410
45	NC_014654	AAAAC	2	10	1827	1836	80 %	0 %	0 %	20 %	312142410
46	NC_014654	TATT	2	8	1855	1862	25 %	75 %	0 %	0 %	312142410
47	NC_014654	A	7	7	1872	1878	100 %	0 %	0 %	0 %	312142410
48	NC_014654	TAATGT	2	12	1924	1935	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312142410
49	NC_014654	AGA	3	9	1942	1950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142410
50	NC_014654	TGCAA	2	10	1969	1978	40 %	20 %	20 %	20 %	312142410
51	NC_014654	ATT	2	6	1988	1993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142410
52	NC_014654	ATTGAA	2	12	2015	2026	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312142410
53	NC_014654	AAAT	2	8	2052	2059	75 %	25 %	0 %	0 %	312142410
54	NC_014654	ATT	2	6	2071	2076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142410
55	NC_014654	TGA	2	6	2098	2103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142410
56	NC_014654	AATTT	2	10	2139	2148	40 %	60 %	0 %	0 %	312142410
57	NC_014654	CTG	2	6	2151	2156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142410
58	NC_014654	TGT	2	6	2239	2244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142410
59	NC_014654	AGA	2	6	2251	2256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142410
60	NC_014654	ATA	2	6	2330	2335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142410
61	NC_014654	GTA	2	6	2352	2357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142410
62	NC_014654	AAT	2	6	2372	2377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142410
63	NC_014654	GTA	2	6	2394	2399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142410
64	NC_014654	CAT	2	6	2568	2573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142410
65	NC_014654	AGA	2	6	2584	2589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142410
66	NC_014654	TGA	2	6	2614	2619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142410
67	NC_014654	AAT	2	6	2623	2628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142410
68	NC_014654	AATT	2	8	2632	2639	50 %	50 %	0 %	0 %	312142410
69	NC_014654	GAAG	2	8	2645	2652	50 %	0 %	50 %	0 %	312142410
70	NC_014654	A	6	6	2703	2708	100 %	0 %	0 %	0 %	312142410
71	NC_014654	GAA	2	6	2759	2764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142410
72	NC_014654	A	6	6	2806	2811	100 %	0 %	0 %	0 %	312142410
73	NC_014654	GGA	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142410
74	NC_014654	ATTT	3	12	2833	2844	25 %	75 %	0 %	0 %	312142410
75	NC_014654	CTT	2	6	2868	2873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142410
76	NC_014654	A	6	6	2893	2898	100 %	0 %	0 %	0 %	312142411
77	NC_014654	GTG	2	6	2962	2967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142411
78	NC_014654	AAG	2	6	2989	2994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142411
79	NC_014654	TGT	2	6	3056	3061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142411
80	NC_014654	A	6	6	3081	3086	100 %	0 %	0 %	0 %	312142411
81	NC_014654	TA	3	6	3087	3092	50 %	50 %	0 %	0 %	312142411
82	NC_014654	ATA	2	6	3104	3109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142411
83	NC_014654	ATA	2	6	3159	3164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142412
84	NC_014654	AT	3	6	3187	3192	50 %	50 %	0 %	0 %	312142412
85	NC_014654	TTA	2	6	3225	3230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142412
86	NC_014654	AGT	2	6	3270	3275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142412
87	NC_014654	TAA	2	6	3289	3294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142412
88	NC_014654	A	6	6	3300	3305	100 %	0 %	0 %	0 %	312142412
89	NC_014654	GAA	2	6	3306	3311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142412
90	NC_014654	AG	3	6	3339	3344	50 %	0 %	50 %	0 %	312142412
91	NC_014654	TGG	2	6	3430	3435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142412
92	NC_014654	GA	3	6	3503	3508	50 %	0 %	50 %	0 %	312142412
93	NC_014654	TTA	2	6	3511	3516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142412
94	NC_014654	ATC	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142412
95	NC_014654	AAT	2	6	3591	3596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142412
96	NC_014654	A	6	6	3621	3626	100 %	0 %	0 %	0 %	312142412
97	NC_014654	CT	3	6	3642	3647	0 %	50 %	0 %	50 %	312142412
98	NC_014654	CTA	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142412
99	NC_014654	ATT	2	6	3684	3689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142412
100	NC_014654	AGT	2	6	3704	3709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142412
101	NC_014654	AGA	2	6	3764	3769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142412
102	NC_014654	AT	3	6	3787	3792	50 %	50 %	0 %	0 %	312142412
103	NC_014654	A	6	6	3811	3816	100 %	0 %	0 %	0 %	312142412
104	NC_014654	TAA	2	6	3845	3850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142412
105	NC_014654	A	6	6	3862	3867	100 %	0 %	0 %	0 %	312142412
106	NC_014654	CA	3	6	3907	3912	50 %	0 %	0 %	50 %	312142412
107	NC_014654	GAT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142412
108	NC_014654	CTG	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142412
109	NC_014654	T	6	6	4066	4071	0 %	100 %	0 %	0 %	312142412
110	NC_014654	AAG	2	6	4088	4093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142412
111	NC_014654	A	7	7	4218	4224	100 %	0 %	0 %	0 %	312142412
112	NC_014654	TGG	2	6	4255	4260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142413
113	NC_014654	AGT	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142413
114	NC_014654	TAC	2	6	4312	4317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142413
115	NC_014654	CA	3	6	4330	4335	50 %	0 %	0 %	50 %	312142413
116	NC_014654	TGA	2	6	4354	4359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142413
117	NC_014654	TAG	2	6	4371	4376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142413
118	NC_014654	CGG	2	6	4383	4388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312142413
119	NC_014654	GA	3	6	4416	4421	50 %	0 %	50 %	0 %	312142413
120	NC_014654	AT	3	6	4424	4429	50 %	50 %	0 %	0 %	312142413
121	NC_014654	GAA	2	6	4481	4486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142413
122	NC_014654	AG	3	6	4512	4517	50 %	0 %	50 %	0 %	312142414
123	NC_014654	TA	3	6	4588	4593	50 %	50 %	0 %	0 %	312142414
124	NC_014654	ATA	2	6	4643	4648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142414
125	NC_014654	TTG	2	6	4688	4693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142414
126	NC_014654	CTG	2	6	4775	4780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142414
127	NC_014654	GGT	2	6	4810	4815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142414
128	NC_014654	GGA	2	6	4822	4827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142414
129	NC_014654	TGT	2	6	4872	4877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142414
130	NC_014654	ATGG	2	8	4893	4900	25 %	25 %	50 %	0 %	312142414
131	NC_014654	TA	3	6	4931	4936	50 %	50 %	0 %	0 %	312142414
132	NC_014654	TAC	2	6	5010	5015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142414
133	NC_014654	AGAT	2	8	5051	5058	50 %	25 %	25 %	0 %	312142414
134	NC_014654	T	6	6	5100	5105	0 %	100 %	0 %	0 %	312142414
135	NC_014654	TTAAAA	2	12	5117	5128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142414
136	NC_014654	TAG	2	6	5136	5141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142414
137	NC_014654	TGA	2	6	5145	5150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142414
138	NC_014654	AGA	2	6	5157	5162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142414
139	NC_014654	ATG	2	6	5174	5179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142414
140	NC_014654	A	6	6	5218	5223	100 %	0 %	0 %	0 %	312142414
141	NC_014654	ATC	2	6	5294	5299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142414
142	NC_014654	TAA	2	6	5331	5336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142414
143	NC_014654	A	8	8	5416	5423	100 %	0 %	0 %	0 %	312142414
144	NC_014654	TGA	2	6	5439	5444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142414
145	NC_014654	AAT	2	6	5484	5489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142414
146	NC_014654	TTG	2	6	5564	5569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142414
147	NC_014654	AGA	2	6	5604	5609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142414
148	NC_014654	TTG	2	6	5633	5638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142414
149	NC_014654	TGC	2	6	5652	5657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142414
150	NC_014654	AGC	2	6	5670	5675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142414
151	NC_014654	AGA	2	6	5698	5703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142414
152	NC_014654	TA	3	6	5780	5785	50 %	50 %	0 %	0 %	312142414
153	NC_014654	TTG	2	6	5786	5791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142414
154	NC_014654	GGT	2	6	5806	5811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142414
155	NC_014654	GAA	2	6	5825	5830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142414
156	NC_014654	TAAA	2	8	5894	5901	75 %	25 %	0 %	0 %	312142414
157	NC_014654	ATG	2	6	5912	5917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142414
158	NC_014654	AGA	2	6	5958	5963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142414
159	NC_014654	ATAA	2	8	5971	5978	75 %	25 %	0 %	0 %	312142414
160	NC_014654	AAT	3	9	5994	6002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142414
161	NC_014654	TTC	2	6	6055	6060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142414
162	NC_014654	TTA	2	6	6079	6084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142414
163	NC_014654	ACC	2	6	6111	6116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142414
164	NC_014654	TA	3	6	6119	6124	50 %	50 %	0 %	0 %	312142414
165	NC_014654	GAA	2	6	6137	6142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142414
166	NC_014654	AAG	2	6	6143	6148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142414
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168	NC_014654	ATA	2	6	6281	6286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142414
169	NC_014654	TGA	2	6	6327	6332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142414
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172	NC_014654	GTAG	2	8	6543	6550	25 %	25 %	50 %	0 %	312142415
173	NC_014654	TAA	2	6	6632	6637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142415
174	NC_014654	A	6	6	6645	6650	100 %	0 %	0 %	0 %	312142415
175	NC_014654	TTG	2	6	6661	6666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142415
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178	NC_014654	ATAA	2	8	6867	6874	75 %	25 %	0 %	0 %	312142415
179	NC_014654	TGA	2	6	6902	6907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142415
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181	NC_014654	CAA	2	6	6991	6996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142415
182	NC_014654	TCC	2	6	7001	7006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312142415
183	NC_014654	ATTA	2	8	7043	7050	50 %	50 %	0 %	0 %	312142415
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189	NC_014654	A	7	7	7275	7281	100 %	0 %	0 %	0 %	312142415
190	NC_014654	A	6	6	7303	7308	100 %	0 %	0 %	0 %	312142415
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199	NC_014654	GAA	2	6	7543	7548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142415
200	NC_014654	TAGA	2	8	7573	7580	50 %	25 %	25 %	0 %	312142415
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253	NC_014654	AAGT	2	8	15802	15809	50 %	25 %	25 %	0 %	312142416
254	NC_014654	AATT	2	8	15871	15878	50 %	50 %	0 %	0 %	312142416
255	NC_014654	TTG	2	6	15913	15918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142416
256	NC_014654	GCT	2	6	15960	15965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142416
257	NC_014654	ATT	2	6	15972	15977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142416
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259	NC_014654	GCA	2	6	16035	16040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142416
260	NC_014654	GCA	2	6	16155	16160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142416
261	NC_014654	ACT	2	6	16375	16380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142417
262	NC_014654	ATG	2	6	16406	16411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142417
263	NC_014654	GTT	2	6	16417	16422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142417
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265	NC_014654	ATC	2	6	16558	16563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142417
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267	NC_014654	GTT	2	6	16597	16602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142417
268	NC_014654	AGA	2	6	16654	16659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142417
269	NC_014654	TGA	2	6	16674	16679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142417
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271	NC_014654	ATT	2	6	16944	16949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142417
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275	NC_014654	ATT	2	6	17193	17198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142417
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283	NC_014654	CTT	2	6	17586	17591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142417
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289	NC_014654	A	6	6	17797	17802	100 %	0 %	0 %	0 %	312142417
290	NC_014654	A	7	7	17837	17843	100 %	0 %	0 %	0 %	312142417
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298	NC_014654	TGGT	2	8	18254	18261	0 %	50 %	50 %	0 %	312142418
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388	NC_014654	ATTA	2	8	21627	21634	50 %	50 %	0 %	0 %	312142421
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390	NC_014654	A	6	6	21929	21934	100 %	0 %	0 %	0 %	312142422
391	NC_014654	TAA	2	6	21940	21945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142422
392	NC_014654	TGT	2	6	21955	21960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142422
393	NC_014654	GCC	2	6	21989	21994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312142422
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395	NC_014654	GTG	3	9	22074	22082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142422
396	NC_014654	TTG	2	6	22113	22118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142422
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401	NC_014654	GTG	2	6	22368	22373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142422
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